近几年来,蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)其遗传转化效率高、生长周期短、基因组小、自花授粉、固氮效率高、可被侵染的根瘤菌范围广等特点[3],迅速成为新进的豆科模式植物并广泛应用于基因组学的研究,帮助研究人员获得了大量具有特殊表型的豆科植物突变体。通过对苜蓿突变体的研究,发现MtDMI3基因编码一种依赖钙调蛋白的蛋白激酶(Calcium and Calmodulin-dependent Protein Kinase,CCaMK),是调控豆科植物根瘤以及菌根共生形成的重要信号传导因子[4]。CCaMK蛋白一般由1个激酶区、1个自抑制区和3个EF-hand组成[5]。CCaMK的EF-hand区可与游离Ca2+的结合诱导CCaMK自磷酸化[6],从而增强了CCaMK与钙调素(Calmodulin,CaM)的结合,后一种结合会解除自抑制区的抑制,使其激酶活性得以表达,诱导根毛表皮细胞发生形态变化,最终形成根瘤。因此,充分了解CCaMK与互作蛋白间的具体作用关系是研究豆科植物共生固氮的必经之路。
在探索蛋白质-蛋白质相互作用的研究中,由Fields[7]等人提出的酵母双杂交系统在应用上表现出显著的技术优势。这是一种既简捷又高效的鉴定真核细胞基因的方法,它不仅可以检测已知蛋白质之间的相互作用[8],还可以结合cDNA文库一起使用,发现能与已知蛋白相互作用的未知蛋白。该系统功能的实现取决于转录活化因子GAL4上两个相互独立的结构域,分别是DNA结合结构域(GAL4-BD)和转录激活结构域(GAL4-AD)。单独的GAL4-AD和GAL4-BD都不足以激活下游基因的转录反应,只有当它们表达的蛋白间发生相互作用时,才表现出完整的转录活性,进而启动报道基因的表达。
酵母双杂交系统在被广泛应用中得到不断改进和发展,衍生了基于不同适用范围和不同物种的杂交技术,其灵敏度和特异性也得到了显著提高,解决了大量基因在生物功能上的相关性问题。因此,本研究将借助酵母双杂交技术,对苜蓿GmYH57与CCaMK蛋白间的相互作用关系进行鉴定,为调控根瘤形成过程中的信号转导奠定基础,进而优化豆科植物生物固氮机制。
一 材料与试剂
1.1主要材料:
1.1.1植物材料:
野生型蒺藜苜蓿幼根,由所在实验室提供。
1.1.2菌株和质粒:
(1)菌株:大肠杆菌菌株Trans1、酵母菌株YRG-2均由所在实验室保存。
(2)载体:T载体(pEASY®-Blunt Zero Cloning)、pAD-GAL4-2.1载体、pAD-GAL4-OE IPD3和pBD--GAL4-OECCaMK表达载体、pBD-GAL4-OECCaMK表达载体,均由所在实验室构建并提供。
1.2主要设备:
微量分光光度计,凝胶成像仪,小型电泳仪,漩涡震荡仪,掌上离心机,4℃离心机,冷冻离心机,恒温摇床NHY-111C;超净工作台;30℃培养箱;高压灭菌锅、无菌操作台。
1.3.主要试剂:
1.3.1化学试剂:
液氮、10×H Buffer、5×Buffer;Yeast Extract(酵母提取物)购于 OXOID;Agar B 购于生工; 琼脂糖购于 BIOWEST;DNA Marker购于 BIOMED;卡那霉素(Kan.)和 氨苄青霉素(Amp),10×loading Buffer,EB;ddH2O、DMSO、LB、1M LiAc、50% PEG3350、鲑鱼油Boiled ss-Cawier DNA均由所在实验室配置并提供。
1.3.2酶和引物:
(1) 酶:Taq聚合酶,Sal I和Xho I限制性内切酶, T4 DNA连接酶、PCR酶(2×HLingene PCR Master Mix)均购于 TaKaRa公司。
(2)引物:OEYH57-F/R由所在实验室根据GenBank公布的苜蓿基因序列,结合酵母表达载体pAD-GAL4-2.1的阅读框和多克隆位点进行设计并提供。
OEYH57-F:5′-CCG CTCGAG ATGGCATCATCAGGTGAAGTTG--3′
(Xho I)
OEYH57-R:5′-GC GTCGAC CTAATGAGCACTTGGTGCGTC--3′ 酵母双杂交验证GmYH57与CCaMK蛋白的相互作用(2):http://www.chuibin.com/shengwu/lunwen_206632.html

