摘要：温郁金（Curcuma wenyujin）是浙江省特色药用植物。本研究采用高通量测序技术对温郁金叶绿体基因组进行测序，并对温郁金的叶绿体基因组进行了注释和结构特征分析。研究结果表明，温郁金叶绿体基因组是一个典型的四分体结构，包括LSC、SSC、IRA和IRB四个区域。叶绿体基因组全长161997 bp，共包括132个基因，其中包括86个蛋白质编码基因(9个基因在反向重复区重复)、38个转运RNA（tRNA）基因以及8个核糖体RNA (rRNA)基因，总共132个基因。通过对温郁金叶绿体基因组的研究，将对温郁金种植资源鉴定及系统发育研究奠定重要基础。

Abstract：Curcuma wenyujin is a characteristic medicinal plant of zhejiang province. In this study, high throughput sequencing technology was used to sequence the chloroplast genome of Curcuma wenyujin, and the chloroplast genome of Curcuma wenyujin was analyzed by annotation and structural features. The results show that the chloroplast genome is a typical tetrad structure, including LSC, SSC, IRA and IRB. Total chloroplast genome is 161997 bp in length, and contains 132 genes, including 86 protein-coding genes (9 genes in reverse repetitive area), 38 transfer RNA (tRNA) gene and 8 ribosomal RNA (rRNA) genes. Through the study on the chloroplast genome of Curcuma wenyujin, it will lay an important foundation for resource identification and phylogenetic research of Curcuma wenyujin.

关键词：药用植物；温郁金；叶绿体基因组；高通量测序技术

Key words: medicinal plants; Curcuma wenyujin; Chloroplast genome; High throughput sequencing technology.

目录

浙江省特色药用植物温郁金叶绿体基因组研究 2

摘要 3

1前言 5

1.1温郁金植物简介 5

1.2叶绿体基因组 5

1.2.1叶绿体基因组结构特征 6

1.2.2叶绿体基因组测序进展 6

1.2.3叶绿体基因组的应用 6

1.3研究的目的和意义 7

2温郁金叶绿体基因组测序研究 7

2.1实验材料、试剂及仪器 7

2.1.1实验材料 7

2.1.2试剂及实验仪器 7

2.2实验方法 8

2.2.1温郁金总DNA提取及质量检测 8

2.2.2 Long PCR扩增 9

2.2.3温郁金叶绿体基因组测序 10

2.2.4温郁金叶绿体基因组拼接及组装 10

2.2.5温郁金叶绿体叶绿体基因组注释及分析 10

2.2.6重复序列与SSR位点分析 11

3实验结果与分析 11

3.1 温郁金DNA提取及检测结果 11

3.2 温郁金叶绿体基因组测序结果 11

3.3 温郁金叶绿体基因组分析 11

3.3.1 叶绿体基因组结构与组成分析 11

3.3.2 叶绿体基因组重复序列及SSR位点分析 13

4讨论 15

参考文献 16

浙江省特色药用植物温郁金叶绿体基因组研究:http://www.chuibin.com/jingji/lunwen_206537.html