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Ⅰ型1系鸭肝炎病毒(DHAV-1)实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立(4)

时间:2025-11-05 22:04来源:100742
试剂 体积(L) 终浓度(/L) 上游引物 1.25 2.510-8mol 下游引物 1.25 2.510-8mol dNTP Mix 25 dd H2O 20 模板 2.5 2.2.4扩增产物鉴定 1) 制胶 称取约0.45g琼脂糖粉末,倒入

试剂 体积(μL) 终浓度(/μL)

上游引物 1.25 2.5×10-8μmol

下游引物 1.25 2.5×10-8μmol

dNTP Mix 25 ——

dd H2O 20 ——

模板 2.5 ——

2.2.4扩增产物鉴定

1) 制胶

称取约0.45g琼脂糖粉末,倒入三角锥形瓶中,加入30mL TAE(1×)溶液。将三角锥形瓶放置于微波炉中用中火加热至溶液沸腾(约1-2min)。戴上耐热手套,小心地取出三角锥形瓶并轻轻晃动内部溶液,直到琼脂糖粉末完全溶解。待溶液冷却到不烫手时(约40℃),向其中加入5μL Gelred核酸染料,摇匀后缓慢倒入制胶模中(避免产生气泡),根据样品数及上样量选择相应梳子插在适当位置上,静置,待其完全凝固后拔下梳子备用。

2) 上样

用微量移液器将8μL的Marker 2000添加至标准孔中,并将50μL PCR扩增产物添加至样品孔内。

3) 电泳

样品添加完成之后,关上电泳槽盖,立即打开电源。110V电压下恒压电泳40min。

4) 观察

在紫外灯光下观察凝胶并拍照,结果如图2-2所示。

2.2.5目的片段回收

DNA片段回收用的是QIAGEN的Gel Extacqion Kit商品化试剂盒,具体回收步骤如下:

1) 取1500μL EP管,准确称量空管质量。根据紫外灯照射下所观察到的DNA条带位置切割下含有条带的琼脂糖凝胶,切碎后放入EP管中,精密称量总质量并计算出所切割下来的琼脂糖凝胶的质量。

2) 将体积为琼脂糖凝胶质量3倍的Buffer QX Ⅰ溶液加入到EP管中。

3) 重悬QIAEX Ⅱ溶液,取30μL加入到EP管中。

4) 将装有混合液的EP管放入到预先升温至50℃的水浴锅中孵育,每隔2min重悬一次以保证QIAEX Ⅱ溶液分散均匀,10min后取出EP管,此时体系为黄色。

5) 室温条件,转速12000rpm离心30s。

6) 弃去上清,沉淀中加入500μL的Buffer QX Ⅰ溶液,轻轻重悬,并在室温条件下以12000rpm的转速离心30s。

7) 将沉淀物用500μL已预先加入了无水乙醇的Buffer PE缓冲液洗涤2次,轻轻重悬后在室温条件下以12000rpm的转速离心30s。

8) 弃去全部上清液(尽可能吸出),打开盖子空气干燥15min,直至沉淀全部变白。

9) 加入20μL ddH2O轻轻重悬沉淀,在静置5min使沉淀完全溶解,在室温条件下以12000rpm的转速离心30s,吸出所有上清液,将其转移到另一干净的1500μL EP管中,放于-20℃保存以备后用。

2.2.6浓度测定

使用微量分光光度计测定DNA片段回收液中DNA的浓度。

2.2.7载体连接

按表格6中各试剂用量在500μL EP管内配制5μL体系,轻轻吹打使体系内溶液充分混匀,随后向体系内加入等体积的Solution Ⅰ溶液。将整个反应体系置于16℃水浴锅内作用30min,然后放-20℃冰箱以备后用。 Ⅰ型1系鸭肝炎病毒(DHAV-1)实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立(4):http://www.chuibin.com/yixue/lunwen_206218.html

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